是合法的，但必须得到政府部门的同意，遵守政府的决定，还应注意个人隐私的保护。《国家突发公共卫生事件应急预案》规定：(8)开展群防群治：街道、乡(镇)以及居委会、村委会协助卫生行政部门和其他部门、医疗机构，做好疫情信息的收集、报告、人员分散隔离及公共卫生措施的实施工作。根据上述规定，社区有权采取小区封闭的措施，保证小区居民的出入安全。